DMTCS Proceedings, 25th International Conference on Formal Power Series and Algebraic Combinatorics (FPSAC 2013)

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Some simple varieties of trees arising in permutation analysis

Mathilde Bouvel, Marni Mishna, Cyril Nicaud

Abstract


After extending classical results on simple varieties of trees to trees counted by their number of leaves, we describe a filtration of the set of permutations based on their strong interval trees. For each subclass we provide asymptotic formulas for number of trees (by leaves), average number of nodes of fixed arity, average subtree size sum, and average number of internal nodes. The filtration is motivated by genome comparison of related species.
Résumé Nous commençons par étendre les résultats classiques sur les variétés simples d'arbres aux arbres comptés selon leur nombre de feuilles, puis nous décrivons une filtration de l'ensemble des permutations qui repose sur leurs arbres des intervalles communs. Pour toute sous-classe, nous donnons des formules asymptotiques pour le nombre d'arbres (comptés selon les feuilles), le nombre moyen de nœuds d'arité fixée, la moyenne de la somme des tailles des sous-arbres, et le nombre moyen de nœuds internes. Cette filtration est motivée par des problématiques de comparaison de génomes.

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